S2, E9: Scofield manque de se faire prendre au jardin botanique où il allait récupérer de l'explosif qu'il avait caché. Il apprend que Mahone a récupéré son disque dur et s'en sert pour le retrouver. Scofield enquête sur Mahone, et va interroger sa femme, se faisant passer pour un agent d'une enquête interne du FBI. Sara comprend ou est le point de rendez-vous avec Scofield et part pour le Nouveau-Mexique. C-Note retrouve ses copains de son ancien gang, et organise avec eux de retrouver sa femme et sa fille malgré le FBI. Burrows et son fils continuent leur route pour retrouver Scofield, mais ils se font repérer dans une gare.