S1, E1: Après une bagarre dans le métro avec une bande de jeunes délinquants, John Reese, un ancien agent secret devenu SDF, se voit offrir un travail par un mystérieux Monsieur Finch. Après les attentats du 11 septembre, Finch a mis au point un programme informatique visant à recouper d'énormes quantité d'informations pour détecter des schémas de comportement ou d'activité trahissant des intentions terroristes. Ce système, appelé « la Machine » peut également prédire les menaces criminelles pesant sur certains individus. Ces informations, jugées non-pertinentes sont négligées par les autorités. Mais Finch veut pouvoir intervenir et se ménage secrètement un accés aux données. Mais pour éviter d'être repéré, cet accès doit être limité. Finch doit se contenter des 9 chiffres d'un numéro de sécurité sociale, sans savoir si la personne correspondant à ce numéro sera la victime ou l'auteur du crime. La première sur la liste est Diane Hanson, une magistrate, qui travaille sur un gros procés. Reese accepte de travailler avec Finch et son enquête met au jour un réseau de complicités entre la magistrate et plusieurs flics corrompus, visant à détourner l'argent des trafiquants de drogue. Parmi ces flics se trouve un certain Fusco, que Reese décide d'épargner pour pouvoir se servir de lui comme informateur. Il faut dire que les agissements de Reese ont éveillé l'intérêt du Lieutenant Carter, bien décidé à savoir qui il est.