Uniques survivants du massacre de Wolf 359 Borg, le commandeur Sisko et son fils Jake débarquent sur la station spatiale "Deep Space 9", positionnée à proximité de la planète Bajor et abandonnée par les Cardassiens.
Odo, le chef de la sécurité, est interrogé à propos du meurtre d'un individu étrange, un Bajoran. Jake, le fils du commandant Sisko, que la solitude dérange, sympathise avec Nog, un jeune Ferengi peu recommandable.
Moins de cinq heures avant l'arrivée des forces bajoranes, Sisko continue l'évacuation de Deep Space Nine. Il choisit de rester pour retarder la prise de la station et se réjouit de voir que ses officiers demeurent à ses côtés.
Sur un avant-poste lointain, un équipage non testé s'embarque dans un voyage sans précédent.
Quand Chakotay part en navette pour pratiquer un rituel indien commémorant la mort de son père, il ne sait pas encore qu'il entre dans un territoire kazon-ogla. Kar, un jeune guerrier, le prend alors pour cible.