参加者全員が全裸で走るマラソン大会開催。「アメリカン・パイinハレンチ・マラソン大会」は「アメリカン・パイ」ならではのノリではたまた繰り広げるハレンチコメディ。まだ童貞の高校生、エリック・スタイフラーが卒業まで童貞でいる決心を貫こうと努力する。しかしジムの父親（ユージン・レヴィ）の勧めで全裸マラソンに参加することになり、彼の決心を試すハメに陥る。悪友たちやセクシーな美女軍団が登場してワイルドなレースになることは間違いなし。ゴールに到着するまでドタバタ続きのハチャメチャコメディ。