ほうせきポケモンメレシーたちが平和に暮らす、美しい国"ダイヤモンド鉱国"。巨大なダイヤモンド"聖なるダイヤ"は、鉱国を維持する大切なエネルギー源だが、今まさにその命が尽きようとしていた。ディアンシーはサトシたちに出会い、聖なる力を求めて"生命のポケモン"ゼルネアスを探す旅に出る。