冷酷非情な戦闘マシーンから目覚め、再び人間の心を取戻したリュック。彼は政府に命じられ、より強力なタイプの戦闘マシーン ”ユニソル2500”の開発に携わる。しかし、ある日 ”ユニソル2500” を管理するスーパーコンピューター、SETHが意志を持ち、暴走する。SETHは悪の殺戮部隊と化した”ユニソル2500”を自在に操り、人類に宣戦を布告した。この危機を救えるのは初代ユニソル、リュックただ一人。格段上のパワーを持つ新型ユニソル部隊と、リュックはどう戦うのか！？