遂に始まってしまったライダー大戦で、次々と仮面ライダーたちを倒していくディケイド＝士とそんな彼を止めさせようとする夏海。スーパー死神博士は、ゾル大佐、蜂女と共にスーパーショッカーを結成し最凶最悪の怪人･ネオ生命体を生み出そうとする。一方、鳴海探偵事務所にまたも不思議な依頼を持ってきたのは、街の人気歌手･安妙美。彼女は亡き姉･恵理香を捜して欲しいという。そして、この事件を追う翔太郎とフィリップは、あるきっかけで初めて仮面ライダーW (ダブル)となったあの夜の出来事への記憶を遡る。