サトシたちは旅の途中、水の民の子孫ヒロミとポケモンレンジャーのジャッキーと出会う。ヒロミたちが保護している"蒼海(うみ)の王子"とよばれるポケモン"マナフィ"のタマゴを、海の神殿アクーシャに届けるというジャッキーのミッションに協力することになったサトシたち。そこへタマゴを狙う海賊ファントムが現れた！