「昭和」から「正化」へと歴史を進めた近未来の日本。いまや国家による思想検閲や、メディア規制が横行する社会となっていた。そんな中、検閲に対抗し「本を読む自由」を守っている“図書隊”に所属する笠原郁 (榮倉奈々) は、検閲で取り上げられそうになった大事な本を取り返してくれた憧れの図書隊員を追って入隊、図書特殊部隊 (ライブラリータスクフォース) 所属となった。鬼教官である堂上篤 (岡田准一) の罵倒とシゴキに耐え、上官の小牧幹久 (田中圭)、同期の手塚光 (福士蒼汰) や柴崎麻子 (栗山千明) らと共に厳しい訓練と図書館業務の日々を過ごしていた。そんなある日、堂上らタスクフォースにある指令が下る。