BAU全員の行動を見張り、彼らが解決した事件を再演するレプリケーターが現れた。犯人は3つの州で3名を殺害している。口を縫われた男性の被害者、他人の脚を接合された身元不明者、関節を外され人間マリオネットにされた女性被害者の3名だ。さらにペンシルバニア州フィラデルフィアでは、全採血され、まぶたが切り取られた女性被害者が2名発見され、BAUが現場に到着してからさらに3人目の女性被害者が発見された。BAUへ悪意に満ちたメッセージを送る犯人は一体誰なのか…。
トニーの元相棒ダニーが殺され、ポートキラー事件絡みであることが明らかになる。トニーはボルティモアでの刑事時代やギブスと初めて会った時のことを思い出す。
財務省がハッキング被害に遭い、潜入捜査官とテロ対策に関する数テラバイトのデータが盗まれる。NSAは容疑者を絞り込んでいたが、その1人は謎の男の手にかかって死亡。もう1組の容疑者であるネルソン夫妻は1泊の森林セラピーに参加していたため、エリックとネルがカップルとして潜入し、ケンジーとディークスが監視を行うことに。一方、カレンはヘティに別の任務を言い渡され、サムはアナと組んで現場を検証する。
レッドチームはエルセントロに到着しキャンプを張る。人と武器の密輸が専門の男を割り出すが、護衛と大勢の不法入国者と一緒に死体となって発見される。一方、空港の映像からテロリストと接触する赤いスカーフの男が浮上し行方を追う。
アイダホ州モスコーで海兵隊員が後頭部を撃たれて殺された。カレンとサムはモスコーで世界中を飛び回るNCISの部隊レッドチームと合流する。一方LAではテロリストのアパートを突き止めテロの準備をしていたことが判明する。
