デュエル・マスターズ クロス

第1話「ザキラ来襲!!」デュエル世界大会、日本予選に参加するため会場に集まる勝舞たち。そこに突如ナゾの集団が現れ大会参加者たちにデュエルを挑んでくる。大会前の腕試しにデュエルを受けて立つ参加者たちだが次々に敗れ氷のような結晶に閉じ込められてしまう！ ナゾの集団の目的は一体何なのか!? 第2話「デリート！」ナゾの集団はザキラの命令で世界各地のデュエリストたちを消すために動いているという。大会参加者に襲い掛かるザキラの手下をとめるため、デュエルする勝舞たち。一方、白凰は何者かの気配を察したかのように市街地の高層ビルに向かう。高層ビルに待ち受けているのは一体!? ＴＭ and (C)2008, Wizards of the Coast, Shogakukan, Mitsui/Kids, ShoPro,TV TOKYO

第3話「白凰死す!?」デュエル・マスターの証を奪うためヤエサル様を手にかけデュエリストたちを消していくザキラ。敵を討とうとザキラに挑む白凰のもとに駆けつける勝舞たち。だが、目にしたものはザキラの圧倒的な強さに屈しようとする白凰の姿だった！ 第4話「ザキラの野望」敗れた白凰を連れ円盤で飛び去るザキラたち。円盤が飛び立ち崩壊していくビルに取り残された勝舞たちだったがデュエル世界大会実行委員のマッキーに助けられる。マッキーから明かされる要塞島での惨劇。その驚くべき内容とは!?

第5話「デュエル・マスターの証」デュエル・マスターの証、ザキラの正体の手がかりを求めてドクター・ルートの研究所に向かう勝舞たち。ドクター・ルートはデュエル・マスターの証を預かり保管していた。ザキラを知るドクター・ルートは勝舞たちを巻き込みたくないと話すのをためらうが…そこにザキラの配下、バベルが迫る!! 第6話「闇眼」ドクター・ルートを逃すためバベルにデュエルを挑む龍牙。だがあえなく敗れ追い詰められるドクター・ルートとジョージ。師匠を守るためバベルとデュエルするジョージだったが、バベルの恐るべき能力、闇眼（やみまなこ）がジョージを追い詰める！ 果たして、ドクター・ルートたちは逃げ切れるのか!?

第7話「証を追え！」谷底の急流に落ちたドクター・ルートを探す勝舞たち。だがドクター・ルートを見つけたのもつかの間、新たな敵、リッチ＆シズカが立ちふさがる！ デュエル・マスターの証を追いかけるリッチ＆シズカを食い止めるためデュエルで立ち向かう勝舞とミミ。だが、予想以上の強さに苦戦を強いられてしまう…。 第8話「愛のデュエル」リッチ＆シズカとデュエルすることになった勝舞とミミ。相手の強力な攻撃に押されていく闘いの最中に二人は重要なことに気がつく。一方、ドクター・ルートに追いついたれく太とジョージだったが、そこでドクター・ルートから意外な言葉を聞かされる。

第9話「紫電ドラゴン」ドクター・ルートを救出することに成功した勝舞たち。だがなんとドクター・ルートが記憶喪失に！ 激しい追っ手の攻撃に対して、勝舞は父から受け取ったバルバルザーク・紫電・ドラゴンを手に、ザキラを倒す決意を固める。しかし新たな追っ手の攻撃が迫っていた！ 第10話「ザキラの怒り」勝舞たちの前に立ちふさがる強敵、イエスマン＆キサナデゥ。絶妙なコンビネーションで攻撃を仕掛けてくる相手に、勝舞の攻撃も通用しない。だが追い詰められたその時イエスマンに異変が…？ 逆転を信じて紫電ドラゴンで挑む勝舞に勝ち目はあるのか!?

第11話「謎のピラミッド」川に落ちたDrルート。後を追っていくと謎のピラミッドの中に入って行ってしまう。勝舞たちも続いて中に入っていくがそこにはザキラの新たな手下、天帝トトが待ち構えていた。仲間同士で本気のデュエルを強要されている少年たちを救うため見えない敵と戦うことになった勝舞とミミだが…？第12話「見えない敵」少年たちを救うため見えない敵と戦うことになった勝舞とミミ。お互い見えない敵に苦戦するが、実は壁を隔てて勝舞とミミがデュエルさせられていた！ 卑劣な罠の前にどうすることもできず見守るれく太たち。果たして勝舞とミミのデュエルの行方は!?