インターネットの投稿ビデオからベンの正体が世界中に知られてしまう。ベンはパパラッチに追われ、ニュース番組ではエイリアンとなって地球を攻撃していると批判され、苦しい立場に追い込まれる。

ベンのパワーが世間に知れわたったことで、かつての敵たちがベンに復讐を遂げようと家族を標的にした。それを束ねていたのはピエロのゾンボーゾ。マックスはベンたちに黙って敵を撃退していたが手に余り...。

ベンは世界的ゲームプロデューサー・オリバーから、ベンを主人公にしたテレビゲームを作りたいと持ちかけられた。喜んだベンは、オリバーの要望どおりエイリアン・ヒーローの動きをスキャンさせ情報を提供する。

ベンたちは、ヒマラヤでドクター・アニモの操るイエティをあっさりと始末。配管工部隊に連絡を取ると、エイリアンがベルウッドの街で暴れていることを聞かされる。3人は急きょベルウッドに戻るのだが...。

アグレゴーから逃げだしたエイリアンのうちの1体・パンドルは、よろいの中に閉じ込められた自分自身を解放するため、大金を積んで、よろいを破ってくれる者を募る。怪しげな男たちが集まるが、うまくいかない。