“特別環境保全事務局（特環）”は、レジスタンス組織“むしばね”のリーダー、レイディー・バードの居場所を突き止めた。“特環”の支部長・土師の命令により、 火種一号指定の虫憑き“かっこう”は、桜架東高校に転校生・薬屋大助として潜り込むことになるのだが…。
大助は､ひとりの少女──杏本詩歌と出会う｡初対面のはずなのに､不思議と気持ちが通じ合うふたりだった｡｢何かあったら､俺を呼んで｣と話す大助に､涙を浮かべて微笑む詩歌｡だが､その様子を監視し､ふたりの行動を逐一チェックしている者がいた…｡
『むしばね』のリーダー・立花利菜は､“ふゆほたる”という虫憑きを仲間にするためメンバーと共に､海浜公園に向かう｡いっぽう､その海浜公園で詩歌と会っていた大助は､土師の命令で､レイディー・バードと戦うように命令されるのだが…｡
かっこうと対峙するレイディー・バード｡そこに割って入ってきたのは､レイディーの仲間・センティだった｡レイディーはセンティと共に､その場から逃走｡しかし､土師率いる『特環』に阻まれてしまう｡攻撃の的となったセンティは､狂気の叫びをあげた…!
利菜を助けるために詩歌は“ふゆほたる”の能力を使うが､昏倒してしまう｡明朝､詩歌が目を覚ますと､そこは利菜の部屋だった｡共に暮らすうち､次第に心を通わせていくふたり｡その頃大助は､真由を撃ったことから四年前の詩歌との出会いを思い出す…｡
自称ジャーナリストで大助たちのクラスメイト・皆川あさみは､虫憑きの謎を追い自分のHPにスクープとしてアップしていた｡しかし､深夜まで作業するあさみに謎の女の魔の手が迫る｡そんな中､利菜は詩歌を放課後の桜架東高校へと連れて来て…｡
