トビオ（窪田正孝）、伊佐美（間宮祥太朗）、マル（葉山奨之）、パイセン（今野浩喜）がイタズラ半分で矢波高に仕掛けた爆弾が思わぬ大爆発を起こし、10名の死者が出る惨事に。 不良たちのリーダー・市橋（新田真剣佑）も死亡したと、蓮子（永野芽郁）から聞かされたトビオは動揺し、逮捕されるとおびえる。そんな中、矢波高の教師・熊野直矢（森田甘路）が犯人を見たと名乗り出て・・・。 矢波高生とマルのトラブルを知った刑事の飯室（三浦翔平）らが凡下高に現れ、担任の菜摘（水川あさみ）に事情を聞く。菜摘は凡下高生の関与を否定するが、事件前夜に矢波高から出てくるトビオらを見ていただけに疑念が拭えない。 深刻な状況を悟ったパイセンは、3人を集め事件について一切口をつぐむよう言い含める。パイセンの提案をのんだトビオらだったが、そのとき、とんでもないニュースが舞い込んで・・・？

目の前でパイセン（今野浩喜）が逮捕され、逃げ出したトビオ（窪田正孝）。だが、自分も捕まるのではないかと怯え学校にも行けず家にも帰れない。まもなく、空港に現れなかったマル（葉山奨之）から電話が入り、一緒に逃げようと提案。さらに、どうせ捕まるのなら“死ぬまでにやりたいこと”をパイセンにもらった金で実現しようと持ちかける。 同じ頃、パイセンは警察で飯室（三浦翔平）の取り調べを受けていた。飯室は矢波高の教師・熊野（森田甘路）の証言などから共犯者がいると確信。パイセンを厳しく問い詰めるが・・・。 病院では、爆発で重傷を負った市橋（新田真剣佑）がリハビリに励んでいた。犯人とにらむトビオらへの復讐を誓う市橋。 一方、“やりたいこと”を実行するため、夜の歓楽街に繰り出したトビオとマルは初めての世界に大興奮！ しかし翌朝、トビオをがく然とさせるまさかの事態が起こり・・・。

罪の意識に苛まれながら逃亡を続けるトビオ（窪田正孝）は、ひょんなことから出会ったホームレスの男・ヤング（桐山漣）に関係を迫られ、絶体絶命のピンチに！だが、このことをきっかけに蓮子（永野芽郁）への思いに改めて気づく。蓮子もまたトビオへの思いを募らせ、市橋（新田真剣佑）とともにトビオの行方を追っていたが・・・。 警察では、突然出頭してきた真中幹男（山本浩司）に署内が騒然となっていた。パイセン（今野浩喜）にそっくりのその男は、爆破事件の真犯人だと名乗り、犯行を自供。飯室（三浦翔平）は、背後で糸を引くある人物の存在を疑い、問いただす。 一方、市橋は久しぶりに登校するが、不良のリーダーとして恐れられていたかつての姿は見る影もなく、矢波高生たちの態度はひょう変。仲間にまで裏切られ絶望する市橋は、蓮子の変わらない態度に励まされる。

爆破事件の真犯人を名乗る真中幹男（山本浩司）が犯行を自供し、パイセン（今野浩喜）は釈放に。大爆発は真中の仕業で、自分たちに責任はないとパイセンから告げられたトビオ（窪田正孝）は、ようやく罪の意識から解放される。 まもなく、伊佐美（間宮祥太朗）とマル（葉山奨之）も戻り、再会した4人。 同じ頃、菜摘（水川あさみ）が不審な動きを見せていた。弁護士の西塚（板尾創路）から金を受け取った菜摘は、その夜、帰宅したパイセンの前に現れて・・・。 一方、事件の結末に納得がいかない飯室（三浦翔平）は、闇社会のドン・輪島（古田新太）が事件に何らかの関わりがあるのではないかと疑い、輪島に会いに行く。 数日後、トビオたちは菜摘からデートに誘われたというパイセンの自慢げな告白に驚く。パイセンはいそいそとデートに出かけていくが、菜摘には全く別の思惑が隠されていた・・・。