墨村良守9歳。間流結界術を受け継ぐ墨村家第22代目当主予定の結界師だ。毎夜、妖を呼び寄せる恐るべき力を秘めた烏森。現在は中高一貫の学園が建つその烏森の地で、妖退治の家業を続けている。同じ家業を継ぐ雪村家の娘、2歳年上の時音は、家同士の諍いもあり、格好のライバルだった。そんな修行の毎日の中、良守は未熟さから、時音を妖に傷つけられてしまう。心優しい良守は、以来、誰かが傷つく事がないよう涙を封じ、強くなることを決意した。そして5年後の現在、14歳になる。

良守は墨村家第21代目当主の祖父である繁守、小説家で普段は主夫を務める穏和な父の修史、そして5歳年下で小学3年生の弟、利守と四人暮らし。昼間は烏森の地に建つ烏森学園中等部に通っている。ちなみに隣家の時音は同じ敷地内の高等部に通う女子高生。夜は妖退治に明け暮れ、昼間は寝不足の良守だが、唯一の趣味には時間を割く。それは洋菓子作り。幼い頃、時音が食べたがったお菓子の城を完成させようと日夜研究に励んでいる。ある日、土蝦蟇が烏森に侵入。退治した良守は密かに手酷い打撲を負うが、時音は傷の手当てにと薬を送る。

雪村家に裏会からの使者、春日夜未が訪れる。今は亡き父、時雄の事を語る夜未に、時音は時雄が死んだ日の事を思い出す。それはとても辛い思い出だった。その夜、烏森の警護に出た良守は、夜未と会い、コミカルな人柄に圧倒される。翌日、再び夜未に会った良守は、時音の父を話題にするのはやめて欲しいと頼む。そんな良守の優しさを甘いと断じる夜未は薬入りのお茶を飲ませて良守を人質にする。鬼のヨキを呼び、妖犬斑尾を倒した夜未は、駆けつけた時音を呪力封じの岩に封じ、烏森の乗っ取りを宣言した！

烏森の力でヨキを強化したい！ そんな願いに突き動かされた夜未は時音を邪魔者として殺そうとするが、囚われの身の良守が結界で脱出して時音を助ける。だが、烏森の力で進化したヨキは、夜未との契約も破棄し、言う事も聞かなくなる。良守は、暴走したヨキをなおも大事に思う夜未の気持ちを察し、ヨキを滅せずに助けようと結界に封じる。しかし、そこへ裏会の追っ手が駆けつけ、ヨキを粉砕してしまう。裏会を欺いた夜未は捕らえられ連行される。その別れ際、良守はヨキの角のかけらを返す。とそのかけらから小さなヨキが再生する。

夜未の事件で、兄である正守の消息を知る良守。正守は異能者の組織「裏会」に所属していた。だが、兄のことよりも大事なことがある良守。いつか時音にお菓子の城を食べさせるという野望のため、ケーキ作りに勤しんでいた。そんなある日、元パティシェの人間霊と知り合う。早く成仏してくれと願う反面、ケーキの知識を吸収できてちょっと嬉しい良守。そんな時、烏森学園にあやかし変化の気配！ 元パティシェかと駆けつけた良守は邪悪化した人間霊の村上と対峙、説得して学園から連れ出す。

神田百合奈は良守のクラスメート。霊感があることを周囲に隠していたが、良守も霊力があると知り、内心怖がる。ある日、烏森学園の名物、狂い桜が季節外れに開花。百合奈は友人のキョーコ、アヤノと夜桜見物をすることになるが、少し早く到着した百合奈だけが学園に入り、あとからきた良守と時音は、百合奈に霊感があると知らず、眼前で妖相手のバトルをしてしまう。すべてを目撃して泣き出す百合奈を労り、式神に家まで送らせる良守。時音はクラスメートに優しい一面を見せる良守をからかうのだった。