冥王ハーデスとの戦いの最中、12人の黄金聖闘士たちは自らの命と引き換えに嘆きの壁を破壊した。しかし消滅したはずの獅子座のアイオリアはアスガルドの大地で復活していた。そこで1人の少女リフィアと出会う。彼は彼女からヒルダに代わりオーディーンの地上代行者となった男、アンドレアスが大樹ユグドラシルを復活させアスガルドの支配を企んでいる事を聞き、救済を求められる。そんな中、戦いに巻き込まれるアイオリア、そして彼の小宇宙が極限まで高まった時…獅子座の黄金聖衣に変化が起こった!!

黄金聖衣が新たなる姿に変化し、神闘士フロディを打ち砕いたアイオリア。しかし再び謎の文様が浮かび上がりアイオリアは気を失ってしまう。アイオリアを助けるため、奔走するリフィアだったが彼女もまた力尽きてしまう。彼女が目を覚ました時に目の当たりにしたのは一人の少年と黄金の聖衣箱を持つアリエスのムウであった。一方、アスガルドに存在する闘技場に赴いた一人の男、彼もまた自分が蘇った意味を捜し求めていた。彼の名はタウラスのアルデバラン!!

蠍座のミロは遂に神闘士の一角、スルトと対峙する。そしてミロの前に立ちはだかるもう一人の人物、その男は何と黄金聖闘士・水瓶座のカミュであった！ 一方、大樹ユグドラシルへと向かうアイオリアとリフィアは街で偶然、蟹座のデスマスクと出会う。黄金聖闘士とは到底思えない風貌に驚きを隠せないリフィア、それでも彼女はデスマスクにアスガルドの救済を求める。しかしデスマスクは戦いに参加する事を拒むのだった。アイオリアとデスマスク、黄金聖闘士同士の小宇宙による底知れぬ緊迫感が空間一体を覆っていく！

スルトの狡猾な策略によりミロの命運が尽き果てようとした時、現れたのはアテナに仕える最強の黄金聖闘士・双子座のサガであった!! ミロの制止を払いのけ、サガは『ギャラクシアンエクスプロージョン』をカミュ達に放つ！ 一方、デスマスクが密かに想いを寄せるヘレナは残虐な神闘士ファフナーに『病気の治療』という悪魔の手招きに誘われてしまう。花屋が休業しているのを見かけ、不審に思うデスマスクは兄妹達の言動から言い知れぬ不安を拭えぬまま、ヘレナのいる病院へと全速力で駆け出していく!!

『神聖衣』、ムウはシャカから大いなる力の真実を聞く。そして大樹ユグドラシルへと向かうアイオリアとリフィアにムウからのテレパシーが届く。彼の話からユグドラシルの結界を司る大いなる根、グレートルートを三点方向から『神聖衣』により極限まで高めた小宇宙を叩き込む事で、結界を破壊できる事が判明する。同じくテレパシーを聞いたアルデバラン、童虎そしてミロは結界破壊の為、グレートルートへと邁進していく。そんな彼らの前に立ちはだかる闘士達！ それは彼らの想像を絶する相手であった!!

結界『フィンドルの冬』を打ち砕いたアイオリア達、黄金聖闘士達はアンドレアスに誘われるままユグドラシルの内部まで突き進んでいく。リフィアの話によると7つの間にそれぞれ存在する像を破壊する事で邪悪なる存在の成長を阻止する事ができるという。新たな決意を胸に闘いに臨む黄金聖闘士達、しかしリフィアにある異変が生じ始める。一方、アンドレアスはフロディとの会話の中で左目に傷を付けた男を思い出す、その男はアイオリアの兄、射手座のアイオロスであった。アイオロスVSアンドレアスの死闘が今語られる!!