ある日、突如出現した侵略企業ゲドー社の超巨大宇宙戦艦オルクスの艦長アバルト・ハウザーにより、一方的な宣戦を布告されたのだ。この危機に国立科学研究所（スケベイ）の所長、岸田博士はその持てる技術と頭脳を集結。身長40mの女性型巨大ロボット――全領域要撃／支援兵器・All Round Intercept & Escort Lady=ARIEL(エリアル)を開発。そのパイロットに強制的に任命されたのは美亜（みあ）、絢（あや）、和美（かずみ）の3人の少女たち。選ばれたのはフツーの女の子たちだったのである…そして、ハウザーの戦艦オルクスよりさらに巨大な宇宙戦艦が出現。核恒星系より飛来したのは、ハウザーの上役ラグナレク・ゲルバルト・ハウゼン。地球にせまる新たなる脅威!! ARIELのコクピットに無理矢理搭乗させられた3人娘は、この巨大な敵にどう立ち向かうのか!?

新たな来訪者ラグナスはハウザーとは友人であり、戦艦オルクスの経理部長のシモーヌとは幼馴染であった。ラグナスは、彼の思惑もあり、旧友の窮地を救う（？）ため手を貸そうと申し出る。だがハウザーにとっては、ARIELがハウザー側に与える損害よりも、地球に及ぼす甚大な被害のほうが問題だった。そのころSCEBAI所内に非常警報が響き渡っていた。謎の飛行物体が東京を目指して降下中だという。ARIELは緊急発進!!（スクランブル）だが、これこそがラグナスの作戦だった。機動兵器を誘い出した後、その基地を制圧するのが彼の真の狙いだったのだ。ラグナスを筆頭に大挙して降下してくる侵略者の群れ。SCEBAI最大の攻防戦がここに始まった…。

年の瀬も押し迫ったクリスマス。富士山麓にあるSCEBAIでも、盛大なクリスマスパーティが催されていた。だが、その頃ヨーロッパでは、東西の両勢力がありったけの戦略核ミサイルを、衛星軌道上の戦艦オルクスに対して発射する。メインエンジンの保守点検の行き届かなくなり、作動不能に陥った戦艦オルクスが地球に落ちようとしていた。年が明けた新年、岸田博士は日本の首脳陣に対し、「すべて」を任せてほしいと訴える。そして、国立科学技術研究所＜SCEBAI＞の総力をもって、巨大戦艦を再び衛星軌道に戻す破天荒な作戦が開始されようとしていた。美亜、絢、和美そしてARIELは人類に明日をもたらすべく、地球を救うことができるのか!? そして、絢の入学試験の結果は如何に!?