莫大な太陽エネルギーが盗まれるという大事件が発生！ 黒幕として浮かび上がったロボットマフィアの首領ブランチに対抗するため、敷島博士は「鉄人28号」の出撃を決意した！

大塚警部を拉致し、正太郎をおびき出して鉄人のコントローラーを奪うことに成功したブランチ。悪の手に落ちた鉄人は街を破壊する！ コントローラー奪還の手段はあるのか!?

敷島博士を乗せた超特急列車が謎の暴走を始める！ 鉄人で列車を止めようとする正太郎だが、操縦に自信が持てず捕まえられない。そして、他の列車と衝突という危機が！

緑色の雨によって多くの人々や建物が瞬時に消滅する事件が続発！ 現場で目撃された怪鳥ロボット。その行動経路をたどり、正太郎と大塚警部は鉄人でハワイの調査に乗り出す！

忽然と姿を消してしまう怪ロボットによって現金強奪事件が発生！ 犯人のリバーキャットからもたらされた次なる犯行予告は「鉄人28号を盗む」という大胆不敵なものだった！

エーゲ海を航行中の貨物船が謎の巨大怪物に襲撃され沈没！ 現地で海中調査を始める正太郎たちの前に1人の少女が現れ、「海をそっとしておいて」と懇願。困惑する正太郎は…。