SONIC X

Dr.エッグマンとのカオスエメラルド争奪戦の末、時空を越えて人間のいる世界にやってきたソニックが高速道路を駆けめぐる。そこへ高速パトロールのSチームが現れ、ソニックの暴走をくい止めようとするがあまりの早さに相手にならない。チェイスの末、ソニックは高速道路の切れ目に向かって走ってしまい、ある豪邸のプールへと落ちた。泳げないソニックはそこに住む少年クリスに助けられた。

前回の事件で大統領はソニックの存在、エッグマンの科学力に脅威を抱いていた。そしてクリスの学校の先生になりすましたエージェント（スチュワート先生）を送り込んだ。そんな時、機械を狂わせる謎の石が発見されたことが報道され、それがカオスエメラルドだと知ったソニックたちとエッグマンが現地に行って争奪戦をする。そしてクリスはカオスエメラルドをゲットしたが高いところから落ちそうになってしまう！

ソニックたちと別れ、単独行動を取っていたナックルズは街に身を潜めていた。そこへDr.エッグマンが接触してきて「自分はカオスエメラルドを集めて元の世界に戻そうと思っている。今までの悪事はわびるからソニックをやっつけてくれ」と訴えた。ナックルズはその言葉に騙された。そのとき、正体不明の宝石が発見されたとの報道。実はエッグマンの企てた罠なのだがソニックたちと、ナックルズは向かった。そこでソニックとナックルズの対決が始まった。