세계에서 가장 큰 비행선에서 절체절명의 사건이 벌어진다. 의문의 바이러스로 인류의 생명을 위협하는 조직부터 무언가를 노리고 코난과 전면 승부를 원하는 괴도 키드까지 남도일에게 도전장을 내민다. 코난은 사건의 전말을 파헤치려 한다.