오랜만에 평화로운 휴가를 즐기던 짱구네 가족은 갑자기 흰둥이 엉덩이에 붙은 의문의 기저귀를 발견한다. 이윽고 국제우주감시센터로부터 흰둥이 기저귀의 정체를 알게 된 짱구는 지구를 없앨 수 있는 기저귀를 쫓아 세계를 구하러 나선다.