어느 날, 어른들이 자신의 어린 시절을 추억할 수 있는 박물관이 설립되고, 짱구의 부모님은 물론 마을의 모든 어른들이 아이들을 버려두고 어디론가 떠난다. 짱구와 친구들은 20세기를 그리워하는 인물 켄이 현재를 다시 과거로 되돌리기 위한 계략을 세운 것을 알게 된다. 사랑하는 가족들을 지키기 위한 짱구의 모험이 펼쳐진다.