연방 경찰 증인보호 프로그램 전문가 존 크루거. 크루거의 임무는 국가 기밀 과 관련된 결정적인 증거를 알고 있는 증인이 위험에 처할 경우, 증인의 목숨 을 구하는 동시에 증인의 모든 과거기록을 지워버리는 것이다. 한편 방위산업 체의 중역인 리 컬른을 제거하기 위해 암흑세력들이 움직이고 있다. 만약 그 녀가 가지고 있는 정보가 미국 밖으로 누출되면 전세계의 힘의 균형이 일대 혼란을 초래하게 된다. 위기에 처한 그녀는 자신의 존재를 지워버리기 위해 "이레이져"인 존 크루거에게 도움을 청한다.
