어느 날 우주로 향한 유인 탐사선 노틸러스호는 태양 흑점 폭발로 경로에서 벗어나 지구와의 송신이 끊기고 만다. 같은 시각 지구에서는 통신 두절, 운석 충돌 등 알 수 없는 일들이 벌어지기 시작하고, 라디오 방송을 송출하던 대학생 무리는 우연히 노틸러스호의 신호를 잡는다. 한편 태양의 이상 현상으로 궤도를 이탈한 수성이 지구와 충돌할 수 있다는 것을 깨달은 프레스톤 박사는 노틸러스호를 이용하여 행성 방어 시스템을 가동하고자 한다.