기동전사 건담 수성의 마녀

바나디스 기관은 건담 르브리스의 시험 가동을 준비하지만, 성과를 보이지 못한다. 파일럿 엘노라는 딸 에리크트를 달래려 르브리스에 태웠다가 르브리스와 딸이 연결되는 사고를 겪는다.

우주 산업계 대기업 베네리트 그룹이 경영하는 아스티카시아 고등 전문 학원. 수성에서 온 편입생 슬레타 머큐리는 학원에서 시작될 새로운 생활에 마음이 설렌다. 그런데 도착 직전, 슬레타는 우주를 떠다니는 형체 하나를 발견한다.

슬레타는 구엘과의 결투에서 승리하지만, 자신의 모빌슈트인 에어리얼에 금지된 마녀의 기술 건드 포맷이 사용됐다는 혐의를 받게 된다. 한편 미오리네는 아버지인 델링에 의해 퇴학 위기에 처한다.

슬레타는 강제로 재결투를 하게 된다. 에어리얼의 폐기와 미오리네의 퇴학을 막기 위해 두 사람은 힘을 합치지만, 결투 상대인 구엘 역시 절대 이 싸움에서 질 수 없다.

엘란을 이용해 에어리얼의 비밀을 파헤치고자 하는 페일 테크놀로지스. 슬레타는 자신에게 상냥하게 대해 주는 엘란이 신경 쓰인다. 그러던 어느 날 엘란이 밖에서 만나자고 권유하는데...