클론의 습격과 시스의 복수 사이에 벌어진 클론전쟁에 참전한 아나킨 스카이워커, 요다, 오비완 케노비, 그리고 아소카 타노의 이야기들이 펼쳐진다. 잔혹한 클론전쟁 동안 수많은 제다이들이 은하계의 평화를 지키기 위해 노력한다.
에피소드 1
매복
두쿠 백작은 토이다리아로 가는 제다이 마스터 요다의 배를 습격한다. 요다와 세 명의 클론 대원은 두쿠 백작의 암살자 벤트리스와 드로이드 부대와 맞선다.
에피소드 2
악의 세력의 반란
분리주의자들은 비밀스러운 새 무기로 클론 우주함대를 공포에 떨게 한다. 아나킨과 아소카는 제다이 마스터 플로 쿤을 구하기 위해 서두른다.
에피소드 3
멜러볼런스호의 어둠
그리버스 장군은 신형 전함을 써서 공화국 전함을 무력화시키고 의료 기지를 습격하려 한다. 아나킨과 아소카는 폭격기 Y윙 편대를 지휘해 습격에 대처한다.
에피소드 4
멜러볼런스호 파괴작전
그리버스 장군이 파드메 아미달라와 C-3PO를 인질로 잡자 오비완과 아나킨은 파드메를 구하고 멜러볼런스호를 파괴하려 한다.
에피소드 5
신병
클론 사령관 렉스와 코디는 리시 스테이션을 습격해 오는 코만도 드로이드들을 막기 위해 신병들의 전투 의지를 고취한다.
에피소드 6
알투의 실종
분리주의자들이 전투 중 실종된 R2-D2의 기억 속에서 기밀 사항을 발견하기 전에 아나킨이 R2를 찾으러 나선다.
이안 아베크롬비
코리 버튼
디 브래들리 베이커
캐서린 테이버
애슐리 엑스타인
제임스 아놀드 테일러
앤소니 다니엘스
톰 케인
맷 랜터
매튜 우드
롭 콜만
