평범한 고등학생이었던 알렉스 라이더는 어느 날 삼촌이 갑작스러운 죽음을 맞이했다는 소식을 듣는다. 수상함을 느끼고 삼촌의 흔적을 쫓던 알렉스는 그가 생전 MI6의 비밀 요원이었다는 사실을 알게 되고, 사건의 진실을 파헤치기 위해 특수 요원으로 활동하며 점차 자신의 운명을 깨닫는다.