尚恩安德森和他叔叔完成地心之旅四年後，收到一通來自更令人驚奇偏遠地區的編碼求救訊號：一處地圖上沒有標明的小島，島上不但擁眾多奇特生物，堆積如山的黃金，致命的火山，還隱藏著更多驚人的秘密。已年滿17歲的尚恩，不顧母親（克莉絲戴維斯飾）及新繼父（巨石強森飾）的強烈反對，決定在島嶼海底的地震強波將寶藏永埋地底前，前往這座神秘孤島，同時拯救島上的唯一居民，也就是他長年失散的爺爺（米高肯恩飾）。在說服路易斯古茲曼和父親女兒凡妮莎哈金斯共同組成直昇機小組後，展開了一段全新的旅程，觀眾也可親身體驗創新的3D電腦動畫壯麗美景。