Beck ist ein junger Mechaniker aus Argon City, einer wachsenden Metropole in einer weit entfernten Gegend des Rasters, der gerade von General Tesler, einem Gefolgsmann des berüchtigten Clu, besetzt wurde. Nachdem sein bester Freund Bohdi von Clus Armee skrupellos gelöscht wurde, sucht Beck Gerechtigkeit für seinen verlorenen Freund und startet einen Kreuzzug gegen das Regime. Seine Rebellion erregt die Aufmerksamkeit von Tron, dem größten Krieger, den der Raster je gekannt hat. Er sieht das Potenzial in Beck und ihn bildet ihn zu seinem Nachfolger aus. Nun „der Abtrünnige“ genannt, entfacht Beck eine Revolution, um für die Freiheit des Rasters zu kämpfen.

Becks Training wird unterbrochen, als er gefangen genommen wird und an tödlichen Spielen teilnimmt.

Als Cutler während des Spiels den Kampf gegen Beck aufgibt, wird er zur Desintegration verurteilt und Beck wird freigelassen. Mit der Unterstützung von Tron kann Beck als Abtrünniger Cutler retten und bittet ihn, andere Programme zu rekrutieren.

Beck und Tron bemühen sich gemeinsam, Becks gestohlenen Diskus zurückzuholen. Wenn sie ihn nicht rechtzeitig finden, wird Beck sein Gedächtnis verlieren. Ihre Suche führt sie in eine von Verbrechern beherrschte Stadt, wo sie es mit zwielichtigen Gestalten zu tun bekommen, die ihnen vielleicht helfen können oder aber den Abtrünnigen ausliefern werden.

Zeds Versuch, das Argon-Rennen mit seinem neuen Bike zu gewinnen, wird von Teslers Bohranlage zunichte gemacht. Er schiebt es jedoch auf den maskierten Abtrünnigen Beck. Paige fordert Zed auf, sich einem Team anzuschließen.

Beck begeht einen Diebstahl und muss flüchten. Paige macht bei Hundekämpfen mit.