Unos robots llamados Centinelas atacan a Júbilo en un centro comercial de la ciudad, pero Tormenta y Pícara la salvan y la esconden en la X-Mansion. Los X-Men descubren que el grupo que dirige el Programa de Registro de Mutantes tiene la intención de rastrear y eliminar a los mutantes. Más tarde, los X-Men encuentran la base de los Centinelas y se infiltran en ella para destruir los archivos de los mutantes. El episodio termina en un acantilado cuando Tormenta abre la puerta de una habitación donde se esconden muchos soldados armados, esperando para tender una emboscada a los X-Men.

Lobezno percibe el olor del aceite de las armas de los soldados y cierra rápidamente la puerta antes de que disparen. Tormenta arrastra a los guardias con su fuerza de viento. Después de destruir los archivos de los mutantes, los X-Men escapan en el Pájaro Negro, pero son detenidos por los Centinelas. En el forcejeo disparan a Morfo y se le da por muerto. Mientras lanzan a la Bestia contra la valla electrocutándolo y dándole captura, el resto huye en el Pájaro Negro comandado por Cíclope. Júbilo decide que es mejor quedarse en la X-Mansion.

Los guardias disparan y hieren a Dientes de Sable cuando exigía que liberaran a la Bestia tras el juicio. Cíclope ayuda a llevar a Dientes de Sable a la enfermería de la Mansión. Más tarde, Magneto ataca una base militar de misiles. Mientras los X-Men llegan, Magneto se prepara para lanzar misiles nucleares con el fin de provocar una guerra entre mutantes y humanos. Cíclope, Tormenta y Lobezno se enfrentan a Magneto, pero no pueden detenerlo. Más tarde, Tormenta utiliza su poder de viento y rayos para provocar un cortocircuito entre los misiles, desactivándolos y dejándolos caer al agua. Tras haber evitado una guerra nuclear, los X-Men regresan a la mansión tras comprobar el poder de Magneto.

Magneto destruye una planta química para atraer al Profesor X. Cíclope, Pícara, Tormenta y el Profesor X se dirigen a la planta química, mientras que Júbilo se queda para vigilar a Diente de Sable. El Profesor X entra en la planta química para enfrentarse a Magneto. Del mismo modo en que Magneto parece vencer al Profesor X, el Profesor X obliga telepáticamente a Magneto a recordar sus años de juventud. Magneto huye aterrado. De vuelta a la Mansión X, Diente de Sable gruñe al senador que aparece en televisión y Júbilo se percata de que hay un problema con las ataduras de sus muñecas. Poco a poco se le van soltando y Diente de Sable logra atraparla, pero aparece Lobezno y le ataca. Su pelea se ve interrumpida por el regreso del Profesor X y los otros X-Men.

Un grupo de mutantes llamadas Morlock capturan a Jean y a Cíclope al salir. La líder de los Morlock, Callisto, secuestró a Cíclope para que gobernara a los Morlock junto a ella. Jean usa sus poderes telepáticos y le dice al profesor que han sido capturadas. Lobezno, Gambito, Pícara y Tormenta van a buscarlas. Cuando los X-Men encuentran a Jean y Cíclope, Tormenta reta a Callisto por el liderazgo de los Morlock para salvar a Cíclope y Jean. Callisto no tiene otra opción que aceptar el desafío. Después de una breve lucha, Tormenta derrota a Callisto y se convierte en la nueva líder de los Morlock, pero el haber salvado a Jean y a Cíclope convierte a Callisto en líder en su ausencia.

Lobezno huye a Canadá en busca de soledad en las tierras salvajes canadienses. Encuentra la paz entre un grupo de inuits de la isla de Baffin, solo para descubrir que Diente de Sable lo ha estado acechando y ha secuestrado a la gente de la aldea, y planea matarlos a todos. Lobezno consigue derrotar a Diente de Sable y salvar a los habitantes de la aldea. De vuelta a la X-Mansion, Gambito le dice a los X-Men que oyó a la gente de Genosha dar la bienvenida a los mutantes y que quiere que el equipo pase allí sus vacaciones. El profesor Xavier envía a Tormenta, Gambito y Júbilo a Genosha como turistas. Estando en Genosha un centinela ataca y secuestra a Tormenta, Gambito y Júbilo.