Quando in ospedale arriva suo fratello per un'ernia, Alex deve ottenere l'autorizzazione dalla Bailey per procedere pro bono. Gli amici e i colleghi di Alex scoprono alcuni aspetti del suo passato.
La BAU dà la caccia a un serial killer che si teme abbia un movente razziale.
Le misteriose circostanze della morte di un esploratore artico portano Castle e Beckett negli uffici della CIA; Castle pensa che il killer stia ingannando gli investigatori.
La vita di Dexter sembra tornata sui giusti binari. Individuato un nuovo criminale da eliminare, si ritrova, però, ad uccidere per caso l'uomo sbagliato, il fratello del pubblico ministero Miguel Prado.
Dexter fatica a convincere Rita che la sua proposta sia sincera. Il fratello di Miguel, Ramon, cerca vendetta ed è alla ricerca del responsabile della morte del fratello, ovvero Dexter.