L'ospedale viene colpito da una crisi senza precedenti. Le capacità di Meredith e Cristina verranno messe a dura prova.
Una troupe televisiva visita l'ospedale sei mesi dopo la sparatoria per girare un documentario su come si stanno riprendendo medici e pazienti. Meredith aiuta Cristina a sembrare sicura davanti alle telecamere.
Barney fa di tutto per cercare di aiutare Ted ad accettare la fine della sua storia con Robin, che è tornata dall'Argentina con un bel ragazzo, Gael...
Owen sottopone gli specializzandi a una rigida esercitazione per ottenere una certificazione, mentre Cristina viene lasciata a vigilare un paziente in attesa del trapianto di polmoni.