Quando Alan e Judith litigano durante le prove di uno spettacolo che Jake e i suoi compagni di scuola stanno preparando, Charlie è costretto a gestire da solo una classe intera di bambini di quarta elementare.
La maratona di Boston diventa una scena del crimine quando un cecchino prende di mira i partecipanti. Jane e Maura devono indagare senza dare nell'occhio per non creare il panico generale. Con la guest star BALTHAZAR GETTY.
Adam si unisce alla squadra di scherma della scuola, mentre Beverly gioca a fare Cupido.
Quando Hal caccia Malcolm da casa perché si è comportato male, Reese cerca di approfittare della distrazione di Hal per giocare uno dei suoi brutti tiri. Francis si offende quando il nipote musicista di Otto accompagna musicalmente ogni mossa di Francis.
Mentre Beverly interrompe il compito di educazione fisica di Adam e Dana (Natalie Alyn Lind), Erica punisce Barry per essersi intromesso tra lei e Lainey.