ロサンゼルスに続き、ニューヨークを襲ったシャークネード。二度に渡る危機から人々を救ったフィンは、ホワイトハウスで大統領から勲章を受け取ることに。しかし、二度ある事は三度ある。再び現れたシャークネードによりホワイトハウスは崩落し、ワシントンは壊滅。その猛威はさらに勢いを増す。一方、フィンの妻エイプリルたちが訪れていたユニバーサル･スタジオ･フロリダにも大量のサメが押し寄せ、園内は地獄絵図と化していた。そして、かつてない最大級のシャークネードが迫る…。