地球統合戦争の最中、統合政府と反統合勢力は、南海の島で探索された未知の遺産をめぐって激しい戦いを繰り広げていた。一方、愛機で戦闘に出た青年の工藤シンは、南海の島上空で敵の戦闘機に撃墜され、不時着した島でサラ・ノームという少女に出会う。伝説と最新兵器が交錯する中、若者たちは戦いの果てに何を見るのか？