時代は2166年。不死身の悪人ヴァンダル･サベッジは人類の歴史に破滅をもたらす地球全土の支配にあと一歩と迫っていた。時の番人タイム･マスターであるリップ･ハンターは世界を救うため150年前に戻り、ヒーローや悪党たちを集めてチームを作る。チームはハンターと共にサベッジの野望を阻止するため、過去へと旅立ち、未来に破滅をもたらす前のサベッジとの戦いに挑む。果たして彼らはサベッジの手から人類の未来を救い、“伝説／レジェンド”となることができるのか。

密告によりヴァンダル･サベッジの居場所を知ったチームは、ドクター･シュタインをリーダーに軍用品の取引を行い、サベッジの潜伏先に侵入しようとする。だが、逆に彼らの正体がサベッジにバレて事態は悪化する。一方、スナートとローリーはサベッジを倒すために重大な鍵となるものを盗もうとするが、まだ他のメンバーを信用しきれていない。

リップ･ハンターは、ヴァンダル･サベッジの金融資産を奪い、彼の力を弱めようとする。だが、サベッジの銀行口座にアクセスしようとしたハンターとサラは、彼の手下に見つかってしまう。一方、スナートとローリーは、ジェイこと“ジャックス”に貴重なエメラルドを盗む話を持ちかける。そんな中、ドクター･シュタインは、危険な任務についてレイに助言をしていた。

時は1986年。冷戦直下のソ連で、チームの仲間数名が捕まってしまう。スナートは、収容所に入れられた彼らを救うため、救出計画を練り上げる。チームが作戦を実行しようとする一方、サラはリップ･ハンターから、作戦と並行する秘密の任務を与えられていた。だがその任務は作戦遂行の弊害となりうるばかりか、チームに危険をもたらす可能性を秘めていた。

ウェーブライダーの誤作動で、チームは2046年のスター･シティへ送り込まれる。だが、そこで彼らが目の当たりにしたのは、サベッジを止めることが出来ず、二度と家へも戻れないという恐ろしい未来。街はがれきの山となり、犯罪者が徘徊していた。そんな中、意気消沈していたサラは、昔からの友人であるオリバー･クイーンの身に起こったことを知り、茫然とする。