明神タケルは、夜毎の夢の中で、ギシン星のズール皇帝からの地球壊滅指令を受けていた。拒絶し続けるタケルだが、ある日、ギシン星の刺客がタケルに襲いかかってきた！

タケルは、自分の過去を問いただすため両親の家に。そして父・明神博士は、タケルが実の息子ではないことを明かす。そのとき、再びギシン星の超能力暗殺者による襲撃が！

ガイヤーから発見されたカプセルを分析した大塚長官は、タケルの秘密を知る。そして、ほかのクラッシャー隊員が出撃する中、長官はその秘密のためにタケルを監禁してしまう。

ギシン星人は、ついに六神ロボの発進地点をつかんだ。そして胴体部ロボ「スフィンクス」のいるエジプトが襲撃される。クラッシャー隊はタケルを残し、救援に向かうが…。