ある日、取り壊された建物の地下室の床から若い成人男性と思われる白骨遺体が発見される。だが、埋められた時期も事故か事件かも分からなかった。警部のキャシーは巡査部長のサニーと捜査を始める。取り壊された建物の設計図から、地下室には施工当時の130年前からコンクリート床が敷かれていたことが判明、建設前からあった遺骨かと思われたが、現場から遺体の物と思われる鍵が見つかり・・・。

日記の所有者のジミー・サリヴァンを行方不明者のデータベースで照合すると、1976年に同名の少年の捜索願が出ていた。さらに、DNA鑑定から白骨遺体がジミーだと特定される。キャシーたちは日記に名前があった人物たちを調べる。当時を知る人達の証言や記録から実業家のフィリップ・クロス、ホステルの経理担当だったエリック・スレイター、逮捕歴のあるリジー・ウィルトン、牧師のロバート・クリーヴスにたどり着くが・・・。

警察による捜査が続く中、エリックにケンカによる逮捕歴があることが分かる。サニーはエリックを聴取するが、酒に酔ったうえでのケンカでほとんど覚えていないと主張。また、ジミーの遺体から手首にクギ状の物で刺された痕が見つかる。マフィアたちによる拷問でできた傷かと思われた。そしてついにジョジョという名前の人物が特定できたと連絡が入り・・・。