천재적인 음악 재능을 가진 차유진은 비행기와 배 공포증 때문에 해외에 진출할 수 없고 국내에서 음악 대학에 다니게 된다. 그는 자신이 원하지 않는 교수님에게 배정이 되고 여자 친구에게 차이는 최악의 하루를 보내고, 술에 취해 다른 사람의 집에서 눈을 뜨게 된다. 그는 눈을 떠보니 쓰레기장 같은 방에 있는 자신을 발견하고, 방의 주인이 종잡을 수 없는 독특한 캐릭터인 설내일과 만나게 된다. 교수님은 그와 설내일과 듀엣을 하게 만든다.

내일은 모차르트 피아노 2중주를 준비하며 유진에게 사랑에 빠져 버리고, 그를 스토킹하기 시작해서 일락의 연주를 망친다. 유진은 피아노과에서 지휘과로 전과를 할 생각을 하고, 학교에 유명한 지휘자 마에스트로 슈트레제만이 온다는 이야기를 듣는다.

슈트레제만은 유진의 지휘과 전과를 거부하고, 유진은 포기하지 않고 전과를 계속해서 받아들여달라고 한다. 슈트레제만은 계속해서 어려운 미션들을 그에게 주고 심술을 부린다. 슈트레제만은 결국 유진에게 지휘를 할 기휘를 주는데, 만약 그가 실패하면 전과를 포기해야 한다는 조건을 건다. 내일은 계속해서 유진을 따라다니고, 누군가가 자신에게 물벼락과 낙서 등 악의적으로 테러를 한다는 것을 알게 된다.

A 오케스트라와 S 오케스트라는 경쟁을 하고, 지는 오케스트라는 없어진다는 사실이 공식적으로 발표된다. 유진은 부지휘자의 자격을 박탈당하고, S 오케스트라는 유진 없이 연습이 제대로 되지 않는다. 슈트레제만은 유진이 자신을 대신해서 지휘대에 서자, 배신감을 느끼며 S 오케스트라를 나간다.

가을 콘서트가 다가오고, 슈트레제만은 투표를 하는 대신에 의외의 학생들을 명망 있는 마스터 클래스에 데려오면서 상황을 계속 뒤흔든다. S 오케스트라는 A 오케스트라의 리허설을 보고 전의를 상실하고, 유진은 단원들의 두려움을 없애기 위한 작전을 짠다. S 오케스트라는 개성이 강한 창의적인 공연을 하게 되고, A 오케스트라는 그들의 연주를 보고 불안해한다.

천재 첼리스트 윤후가 물에 빠진 유진을 구하고, 이들은 음악제에서 만나게 된다. 유진은 슈트레제만의 조수로 일하게 되고, 음악제에 도착하자마자 그의 악의적인 심부름으로 괴롭힘을 당한다. 안 교수의 배려 덕분에 일락, 수민, 내일은 음악제에 참가한다. 하지만 이들은 권위적이고 보수적인 수업에 적응하지 못하고, 도 교수는 이들이 사고를 칠까 걱정한다.