은하계 저편 애니멀 트론 종족이 살고 있는 애니멀 플래닛, 애니멀 트론의 왕자 라이온과 그의 친구 코라는 봉인되어 있던 에그킹들의 알이 지구로 떨어지자 다시 에그킹을 봉인하기 위해 지구로 향한다. 함께 사악한 몬스터 에그킹에 맞서 싸우며 어려움을 헤쳐나가는 미니 특공대 애니멀 트론의 이야기가 시작된다.
에피소드 1
새로운 영웅들
미니특공대의 기원이 소개되고 작품의 주인공인 대원들의 멋진 활약이 펼쳐진다. 동물들을 싫어하는 악당, 나인이 기계몬을 보내 동물들을 괴롭히자 대원들이 힘을 합해 막아낸다.
에피소드 2
새로운 위협
미니특공대의 배신자 파스칼과 나인이 손을 잡는다. 파스칼이 투를 거대화시켜 변전소를 파괴하려 하지만 미니특공대는 특공로봇으로 공격해 막아낸다.
에피소드 3
거미 기계몬의 습격
거미 기계몬이 나타나 동물의 에너지를 뺏으며 괴롭힌다. 출동한 미니특공대도 거미줄에 당할 위기에 처하지만 기지를 발휘해 거미기계몬을 물리치고 동물들을 구해낸다.
에피소드 4
오늘의 운세
볼트가 동그라미를 조심하라는 운세를 받고 불안해한다. 마침 전갈 피오와 싸우다가 동그란 마비광선을 맞은 볼트는 패닉상태에 빠진다. 하지만 대원들의 응원에 힘을 낸 볼트, 두려움을 이겨내고 피오를 물리치는데 성공한다.
에피소드 5
거북이들의 용기
폭군 거북이 토레스가 파스칼의 음모에 따라 거북이들을 괴롭힌다. 미니특공대가 출동해 싸우지만 토레스의 강한 등껍질 때문에 애를 먹는다. 겁을 먹고 물러서기만 하던 거북이들이 용기를 내서 힘을 합하고, 미니특공대가 승리한다.
에피소드 6
미니 특공대와 아기 이구아나
파스칼이 이구아나 여왕의 알을 훔쳐다가 미니특공대에게 떠넘긴다. 아기 베베가 태어나고 대원들은 마음을 다해 보살핀다. 여왕의 오해와 파스칼의 음모로 모두가 위험에 처한다. 하지만 감춰진 베베의 능력이 발휘되면서 파스칼을 물리친다.
엄상현
전태열
신용우
이소영
사이먼 소켓
성완경
홍진욱
이영준
