원룸에 틀어박혀 한가롭게 이쑤시개 바람총을 쏘던 하급 닌자 쿠로를 찾아온 택배기사 차림의 중급 닌자 카토. 일을 갖고 왔다는 그가 두고 간 상자 안에는 고등학교 교복, 그리고 후드 집업이 들어 있었다. 내용물을 확인한 쿠로는 자신의 임무가 고등학교 잠입이라는 것을 깨닫는데...

닌자가 되기 위해 일본에 온 의문의 외국인. 그는 어린 딸을 구하기 위해 닌자가 되어야만 한다. 전봇대 아래에서 닌자의 암호로 보이는 문구를 발견한 그는 조직의 동료에게 연락하고, 동료의 엉뚱한 해석으로 외국인은 닌자를 만나기 위해서 성기 절단 사건을 일으키게 되는데...

쿠로는 카토가 준 새로운 임무를 위해 이성에 눈을 뜬 동네 중학생, 에이타를 목표로 삼는다. 카와도의 속옷을 미끼로 에이타를 납치한 쿠로는 그를 회유, 협박해 파란 후드에 안경을 쓴 금발 외국인을 찾으라고 부탁한다. 에이타는 이웃에 사는 소녀, 준나에게 드론을 빌려주겠다며 외국인 찾기를 부탁하는데...

스즈키와 성기 절단 외국인이 격돌하던 중 히비가 등장하며 혼란스러워지는 현장. 그 와중에 민간인인 준나의 의붓아버지까지 싸움에 끼어들면서 혼란이 가중된다. 한편 카토는 쿠로에게 지급된 마리지천 4.0에 대한 의문을 풀기 위해 자신의 제자, 오니코베에게 연락하는데…