평범한 회사원 이나바 토키치는 사랑하는 아내와 아들과 함께 행복한 하루하루를 보내고 있었다. 그러나 어느 날, 토키치는 우연히 범죄 조직 '편의점'의 히트맨 니초가 총격전을 벌이는 상황을 맞닥트리며 터무니없는 일에 휘말리게 된다.
'편의점'의 히트맨 와시오는 동생 타카오가 니초라는 히트맨에게 죽임당했다는 사실을 알고, 분노하며 복수에 나선다. 토키치를 니초라고 착각한 와시오는 가족을 죽이겠다고 토키치를 협박하며 결투를 신청한다.
전설적인 히트맨 니초의 활약으로 편의점 본부에서도 주목받고 있는 나라시노 지부. 지부장 동글이 안경과 버섯 머리는 토키치에게 계속 니초를 연기하게 해서 다른 지부와 격차를 벌리려고 한다. 그러던 어느 날, 토키치의 목숨을 노리는 한 남자가 토키치 앞에 나타난다.
편의점 본부의 본부장 '장군'은 카토의 보고를 듣고 토키치의 실력과 특성을 마음에 들어 한다. 한편, 토키치는 치나츠에게 첫눈에 반한 야마모토를 위해 두 사람의 데이트 자리를 만들어 준다.
칸우에게 돈을 받아내라는 본부의 미션을 먼저 수행하기 위해 경쟁하는 나라시노 지부와 후나바시 지부. 그러나 턱이 고용한 킬러 '스너프킨'은 턱을 배신하고 칸우 측에 붙는다. 스너프킨은 칸우의 지시에 따라 니초를 산 채로 칸우 앞에 데려가기로 한다.
편의점을 배신하고 도망친 옛 그림자 '나즈'. 장군의 명령으로 나즈 토벌대 멤버로 뽑힌 토키치는 카토를 비롯한 히트맨들과 함께 나즈를 말살하러 간다. 그러나 단검의 천재 나즈는 오히려 토키치 일행을 위기로 몰아넣는다.
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