크로스 포토닉스의 CEO 에반 크로스는 회사 내에 특수임무팀을 꾸린 후, 정체불명의 문 '아노말리'가 어떤 식으로 작동하는지 연구를 거듭해왔다. 그러던 중, 동물의 습격을 받고 끔찍하게 사망한 것으로 추정되는 시신을 조사하던 야생동물관리팀 딜런 위어와 우연히 마주친다. 두 사람은 어디선가 갑자기 등장한 육식 공룡의 습격을 피하려다가, 때마침 나타난 아노말리를 통과하는 기적 같은 일을 함께 경험한다.

석유 회사의 시설 확충을 반대하는 시위가 한창인 어느 원주민 마을에서, 배를 타고 바다로 향한 석유 회사 직원 두 명이 감쪽같이 사라져 버리는 사건이 발생한다. 이 마을의 청년 리오 존은 스승인 딜런을 찾아와 실종된 두 사람이 아무래도 전설 속에 등장하는 괴물 시시우틀에 끌려간 것 같다고 털어놓고, 딜런은 에반과 함께 이 괴물의 정체를 추적하기 시작한다.

활주로에 갑자기 생긴 아노말리로 착륙 중이던 경비행기가 빨려 들어간다. 조종사를 구하기 위해 아노말리로 들어가는 에반과 딜런. 두 명의 조종사는 모두 살아 있었지만 사람을 잡아먹는 딱정벌레들이 비행기를 에워싸기 시작하는데...

아노말리 탐지기의 오류로 한 대학 캠퍼스에 나타난 아노말리를 뒤늦게 알게 된 에반 일행. 한 학생을 습격한 공룡을 포획하는 데 성공하지만 아노말리가 이미 닫혀 돌려보낼 방법이 없다. 결국 사만다를 불러서 승합차에 기절한 공룡을 임시로 보관하는데...

사만다의 죽음 후 침체된 분위기의 크로스 포토닉스. 맥은 아노말리 때문에 출동한 현장에서 에반에게 반항적인 모습을 보이고, 앤지는 회사 일에 회의를 느껴 이직을 생각하는데...