공화국 대육군 소속으로 DNA 수준으로 유전자 조작이 가해진 특별한 클론 부대원들로 이루어진 클론 포스 99부대가 클론 전쟁의 종전 이후 급변하는 은하계 속에서 새로운 목적을 찾아 헤메인다.
에피소드 1
끝나지 않은 싸움
배드 배치 특공대는 오더 66이 발동되고 제다이들이 숙청되면서 공화국이 제국으로 바뀌는 과정을 겪는다. 모든 상황이 혼란스러운 가운데 배드 배치는 오메가라는 소녀를 만난다.
에피소드 2
긴급 탈출
오메가와 함께 살루카미로 간 배드 배치 특공대는 그곳에서 클론 탈영병 컷을 만난다. 컷은 배드 포스에게 탈출 계획을 알려 준다.
에피소드 3
후임병
탈출하던 과정에서 타고 있던 우주선이 파손되어버리고 배드 배치와 오메가는 아무도 살지 않는 위성에 불시착한다.
에피소드 4
진퇴양난
연료와 식당이 부족해지고 지명 수배까지 당한 배드 배치는 판토라에서 보급받으려 한다. 그러나 착륙장 주인이 배드 배치를 알아보고 현상금 사냥꾼 페넥 섄드를 부른다.
에피소드 5
광란
판토라를 떠난 배드 배치는 제다이의 정보원 중 하나가 오드 만텔 행성에 있다는 소문을 듣는다. 오드 만텔에서 만난 정보원 시드는 노예상에게 뺏긴 아이를 되찾아 달라고 요구한다.
에피소드 6
취역 해제
시드의 가게에 머물며 용병 일을 하던 배드 배치는 분리주의 연합의 전술 드로이드를 회수하라는 의뢰를 받는다. 코렐리아 폐기장에서 배드 배치는 마테제 자매를 만난다.
디 브래들리 베이커
밍나 웬
스티븐 스탠튼
앤드류 키시노
데이브 필로니
아테나 포틸로
제니퍼 코빗
브래드 라우
