Nemo en zijn medegevangenen in de Kalpani strafkolonie zijn de dwangarbeiders die een onderzeeër bouwen, de Nautilus. Als deze klaar is, willen Nemo en een vertrouwde bemanning ermee ontsnappen. Maar als directeur Crawley arriveert om te eisen dat de Nautilus naar Bombay wordt verplaatst om bewapend te worden, moet Nemo vandaag vertrekken. Met wie hij maar bij elkaar kan krijgen als bemanning.

Nemo moet zijn bemanning verenigen om samen de open zee te bereiken voordat de troepen van de Compagnie hen vangen. Een ontmoeting met walvisjagers vertraagt hen, en net wanneer ze op het punt staan hun vrijheid te bereiken, worden ze afgesneden door de machtige Dreadnought. Een spannend kat-en-muisspel met dieptebommen volgt terwijl ze proberen te ontsnappen.

Op Karajan ontmoet de bemanning de zonderlinge Witte Rajah, maar kunnen ze zijn gastvrijheid wel vertrouwen? Nemo doet een schokkende ontdekking, en Humility en de rest van de bemanning komen erachter wie Nemo werkelijk is.

De bemanning ontdekt een mysterieus tropisch eiland.

De Nautilus wordt meegetrokken in de vulkanische Ring van Vuur.

De Ring van Vuur onthult een aanwijzing voor de legendarische onderwaterstad Atlantis, Benoits levenslange obsessie. Een kleine groep waagt zich naar wat een oude buitenpost van de mythische verloren beschaving lijkt te zijn, maar ze beseffen dat het ook de woonplaats is van duizenden angstaanjagende Crinoïden, en de bemanning vecht om met hun leven te ontsnappen.