Towa Higurashi fica sabendo sobre o incidente de décadas atrás, envolvendo o meio-youkai Inuyasha e a sacerdotisa Agome.

As gêmeas Towa e Setsuna foram separadas quando um túnel misterioso mandou Towa para o futuro, onde foi encontrada e criada por Souta, irmão de Agome Higurashi.

Um youkai surge através da Árvore Sagrada, no Santuário Higurashi, juntamente com Setsuna e Moroha. Towa, Setsuna e Moroha lutam contra o youkai, cujos poderes foram intensificados com as duas Pérolas do Arco-Íris.

A única maneira de Setsuna recuperar os sonhos e lembranças é caçando a Borboleta dos Sonhos; Towa decide retornar à era feudal para ajudar Setsuna e Moroha. O trio segue o caminho pelo corredor, mas encontra o espírito de uma certa sacerdotisa nele.

De volta à era feudal, Moroha vai até o negociante para reivindicar sua recompensa; Towa e Setsuna aceitam um trabalho para matar Jakotsumaru, um menino que tem extraído ossos de humanos e feras para reviver o pai, a fera demoníaca Tokotsu.

Viajantes estão desaparecendo um após o outro. Confiadas pelo negociante Jyubei para desvendar o caso, Towa, Setsuna e Moroha seguem para as montanhas do norte. Em vez de viajantes desaparecidos, elas encontram uma vila tomada por gatos-fantasmas.