Die Mannschaft des Serenity-Raumschiffs hat alle noch brauchbaren Teile aus einem gestrandeten und verlassenen Allianzfrachter geräumt und verkauft sie an die dubiose Lokalbaronin Patience. Die Allianz, die übergreifende Staatsmacht aller Siedlungen im Weltall, hat das Versorgungsschiff daraufhin auf ihre Fahndungsliste gesetzt, was der Weltraum-Crew wenig behagt. Nach einem Halt auf dem Mond Persephone, nimmt die Mannschaft Passagiere an Bord. Unter ihnen die Geschwister Tam und 'Shepherd' Book. Sie wollen künftig an Bord des Transportschiffes bleiben, nachdem sie mit einem Allianz-Agenten Probleme hatten.

Eines Tages wendet sich Adelei Niska an die Crew der Serenity. Er ist eine dubiose Gestalt im Verbrechermillieu. Sein Auftrag an die Mannschaft: sSe sollen Kisten aus einem Passagierzug entwenden. Zunächst sagt die Crew zu. Doch dann kommt heraus, dass es sich beim Inhalt der Kisten um Medikamente handelt. Und die werden von den Einheimischen dringend benötigt. Sofort ist für die Serenity-Leute klar: Bei dem Deal sind sie nicht dabei. Sie blasen die Sache ab. Was Adelei Niska richtig wütend macht ...

Die Serenity stößt bei einem Flug durch das All auf ein treibendes Wrack. Die Mannschaft besteigt das Schiff und nimmt alles mit, was noch brauchbar ist. Dabei wird ein Überlebender entdeckt. Noch während die Crew an Bord des Wracks ist, taucht ein Allianzschiff auf. Der Überlebende läuft Amok und schießt auf das Schiff. Er will eindeutig den Allianzkapitän töten. Malcom kann das verhindern. Gerade noch gelingt es der Serenity zu entkommen.

Wer bekommt den lukrativen Transportauftrag? Raynolds möchte ihn unbedingt haben - und schreckt auch nicht vor Handgreiflichkeiten zurück. Es kommt zum Duell mit einem Kunden von Inara. Im Laufe des Kampfes wird Malcolm verletzt, doch er kann sich retten. Sein potentieller Auftraggeber ist beeindruckt vom Ausgang des Duells und Mal erhält den Auftrag.

Die Serenity hat endlich ihr Ziel erreicht: Sie ist auf einem Planeten angelangt, auf dem die Mannschaft ihre jüngste Transportware verkaufen will. Doch es kommt zu einem Zwischenfall. Die Geschwister Tam werden entführt, damit Simon in einem Bergdorf als Arzt arbeitet. In letzter Sekunde können sie vor einem Mob gerettet werden, der River für eine Hexe hält und sie lynchen will.

Per Zufall kann die Mannschaft der Serenity Siedlern helfen, die von Dieben angegriffen werden. Die Freude über die Befreiung ist so groß, dass die Siedler ein Dankesfest feiern. Ohne es bewusst mitzubekommen, wird Malcolm während der Party mit einer Einheimischen verheiratet. Später stellt sich heraus, dass sie eine Betrügerin ist. Sie sabotiert das Schiff und versucht, die Crew mit Hilfe ihrer Komplizen zu töten. Dies kann gerade noch in letzter Sekunde verhindert werden.