Das Volk des Planeten Irk hat nur ein Ziel: sich das Universum Untertan zu machen. Nach dem ersten fehlgeschlagenen Versuch planen die Anführer der Irks jetzt die Mission „Drohender Untergang 2“! Um den nervenden Zim los zu werden, schicken sie ihn auf die Erde - in der Hoffnung, dass er in den Weiten des Weltalls verloren geht. Doch gemeinsam mit seinem Roboter Gir erreicht Zim die Erde und beginnt sofort, die Invasion vorzubereiten. Er tarnt sich als Schüler und seinen Roboter als Hund. Nachdem sich die beiden eingerichtet haben, schleust sich Zim in eine Schule ein. Dort trifft er auf Dib Membrane, den Sohn eines bekannten Wissenschaftlers. Dib merkt sofort, dass mit Zim etwas nicht stimmt. Doch keiner glaubt ihm, da er an der Schule als Spinner verschrien ist.

Zim hat Probleme, sich auf sein neues Leben einzustellen. So kommt er zum Beispiel mit den Gepflogenheiten eines Mittagessens überhaupt nicht klar. Zufällig belauscht er eine Unterhaltung von Jessica, einem äußerst beliebten Mädchen an der Schule. Sie zieht darüber her, dass Zim nicht gerade viele menschliche Züge hat. Um sich besser in das Leben auf der Erde einfügen zu können, sucht Zim jetzt nach Hilfe. Die findet er in Person von Keef - glaubt er zumindest. Doch Keef ist nicht gerade der Allerhellste… Dib will Zim entlarven und dringt in dessen Wohnung ein, um dort Fotos zu machen. Als Zim dahinter kommt, dringt er mit einem mikrospisch kleinen U-Boot in Dib´s Körper ein. So will er die Fotos vernichten und Dib´s Gedächtnis löschen. Dib will sich mit Hilfe eines ferngesteuerten Nano-U-Boots zur Wehr setzen - doch letztlich kann er nur dank seines Schwester Gaz den ungebetenen Besuch aus seinem Körper vertreiben.

Zim sitzt in der Klemme: In der Schule steht ein Elternabend an. Seine Robot-Eltern kann er da natürlich nicht einfach hinlassen - menschliches Verhalten liegt ihnen nur allzu fern. Das Problem muss innerhalb eines Tages gelöst werden. Also beschließt er, den beiden ein Video zu zeigen, damit sie wissen, wie sie sich zu verhalten haben. Dumm nur, dass Gir den Fernseher dauernd umschaltet und Zims Eltern so auch mit etlichen Werbe-Spots gefüttert werden. Jetzt lernen sie Verhaltensmuster, die den Elternabend zur Katastrophe werden lassen. Zim rüstet seinen RoboDog Gir mit einem neuen Navigations-Chip aus. So sollen die beiden in jeder brenzligen Situation den Weg zurück nach Hause finden. Als Vorsichtsmaßnahme will Zim den neuen Chip zunächst einmal testen, weshalb er sich mit Absicht verirrt. Was der kleine Alien nicht weiß: Gir hat den Chip entfernt, um so Platz für ein Stück Kuchen zu schaffen. Der Heimweg der beiden gerät zur reinsten Odyssee.

Zim stellt fest, dass er total anfällig gegen Keime ist, also sagt er ihnen den Kampf an. Er besorgt sich eine Mikrobrille, um dem Feind ins Auge sehen zu können und entwickelt sich zu einem absolut pedantischen Putzteufel. Dumm nur, dass er darüber alles andere vergisst: die Schule, die Allmächtigen Allergrößten - und auch seine eigentliche Mission! Zim hat’s schwer erwischt: Er hat Kopfläuse und muss in die Krankenstation der Schule. Zur Freude von Dib, denn dort wird Zim endlich als Alien enttarnt - schließlich hat er keine menschlichen Organe. Doch nach guter irkischer Sitte klaut Zim jedem, der ihm über den Weg läuft, ein oder zwei Organe. Dafür gibt’s Geschenke wie Wecker, einer Katze oder einer Dose Bohnen. Die Tauschobjekte transplantiert er dann auch direkt bei seinen Organspendern. Zu guter Letzt fehlt Zim nur noch eine Lunge, und die will er von Dib.

Es ist Nacht und Zim ist unterwegs, um die menschlichen Verteidigungs-Taktiken zu erforschen. Als er nach Hause will, schlägt sein Computer Alarm: jemand kommt ihm in die Quere. Doch alles, was Zim erkennen kann, ist eine Biene. Er glaubt, dass sein Computer langsam durchdreht und macht sich auf den Heimweg. Doch das Insekt hat es faustdick hinter den Ohren: es stellt einen drehenden Feuerball her, der ins Feld kracht. Doch bevor Zim das Phänomen erforschen kann, haben die Saucer Morons schon zugeschlagen… Es regnet - und für Zim ist es das erste Mal, dass er damit konfrontiert wird. Doch schnell hat er heraus: Regen ist etwas Fürchterliches! Vor allem, wenn dadurch auf der Haut lauter Blasen entstehen. Jetzt hat der Alien ein Problem, denn ausgerechnet Dib ist hinter seine Wasser-Allergie gekommen. Damit hat Dib jetzt endlich etwas gegen Zim in der Hand und plant eine Wasser-Ballon-Attacke. Zim arbeitet fieberhaft an einer Abwehr - und wird schließlich fündig. Was folgt, ist eine große Wasserschlacht, bei der nicht nur Zim und Dib nasse Füße kriegen…

Zim und seine Klassenkameraden haben im Rahmen eines Schulpraktikums die Möglichkeit, sich einen Tag lang auf das spätere Berufsleben vorzubereiten. Leider haben die Schüler keinerlei Einfluss auf die Auswahl, und so landet Zim in einem Schnellrestaurant. Dabei will er doch eigentlich Herrscher der Erde werden. Damit sind seine Probleme noch nicht am Ende: Genau am Tag des Praktikums steht Zims große Häutung bevor, und er darf sich nicht von seinem Arbeitsplatz entfernen… Dib möchte die Welt retten. Allerdings braucht er dazu die Unterschrift seines Vaters, des berühmten Professor Membrane. Doch das erweist sich als recht schwierig. Prof. Membrane zeichnet an diesem Tag seine Fernsehshow auf, und der Sicherheitsdienst lässt Dib nicht so ohne weiteres zur Garderobe des TV-Stars durch. Er muss sich der ganzen Aufnahmeprozedur stellen, die auch jeder normale Zuschauer durchlaufen muss. Diese besteht nicht nur aus schriftlichen Tests, sondern auch aus einem harten Zweikampf in der Arena…