Ofelia a quitté l'hôtel seule pour tenter de rejoindre les Etats-Unis. Le groupe qui loge dans l'hôtel s'organise pour lutter contre les infectés, mais leur cohésion reste fragile. Strand se fait poignarder par Ilène, et Madison impose sa loi.
Les habitants de Terra Nova attendent le 11e pèlerinage. Taylor et Jim sont prêts à les accueillir quand soudain un kamikaze se fait exploser. Quelques jours plus tard, Jim se réveille avec stupeur dans une colonie occupée par des militaires et dirigée par Mira et Lucas. Avec l’aide de Taylor, il échafaude un plan pour récupérer Terra Nova et chasser ses nouveaux occupants.
Tandis que Lucas finalise ses recherches pour que le portail fonctionne dans les deux sens et les ramène en 2149, Jim et Taylor découvrent enfin l’identité de l’espion. De son côté, Skye demande de l’aide à Josh pour aider sa mère, prisonnière des Classes Six.