Will Bowman, sa femme Katie et leurs deux enfants vivent à Los Angeles, sous l'occupation d'une puissance extraterrestre dominatrice, qui a nommé des mandataires humains afin de gouverner à sa place. Will tente de sortir du bloc de Los Angeles pour passer dans le bloc voisin de Santa Monica, où leur fils est enfermé depuis "l'Arrivée". Une explosion retentit : Will est arrêté et identifié comme un ancien soldat des forces spéciales et agent du FBI, expert en traque de fugitifs. Plutôt que de s'en débarrasser comme de tous les humains qui avaient ce profil, le mandataire Snyder, qui dirige le bloc de Los Angeles, lui propose de travailler pour lui et lui confie une mission : identifier et arrêter le chef de la résistance : Geronimo. Inquiète d'être sans nouvelles de son époux, Katie demande à ses contacts dans la résistance s'ils savent où est Will. Snyder arrive le lendemain chez les Bowman pour forcer Will à accepter son offre en leur faisant miroiter de meilleures conditions de vie et surtout, une aide pour retrouver leur fils.

Will débute son travail de collaborateur et découvre que Snyder lui a menti : il ne sera pas chef de l'unité, mais aux ordres de Phyllis, la froide et efficace directrice. Il fait équipe avec Beau et Jennifer, analyste. Will et Beau capturent le jeune homme qui avait posé la bombe dans le camion, dont l'explosion a conduit à l'arrestation de Will au check point. En le conduisant en cellule, Will retrouve son ami Carlos, arrêté au garage à cause du matériel volé par Will. Il est censé être envoyé à "l'Usine", où l'occupant expédie quiconque défie ses lois. Maddie, la sœur de Katie, travaille comme serveuse pour une réception dans la villa d'un membre de l'autorité de transition. Elle y retrouve George, un vieil ami, lui aussi collaborateur de haut rang, qui la ramène chez lui. Katie demande à la résistance de l'aider à sauver la femme et le fils de Carlos, mais ils refusent. Will et elle les aident alors à se procurer de faux papiers et à se cacher. Comme son contact, Broussard, le lui a demandé, Katie avertit la résistance que le suspect arrêté a donné à Will le lieu où se cachaient ses complices. Quand Will et Beau arrivent sur place, ils ne trouvent que des cadavres...

Katie participe à sa première opération dans la résistance et Justin Kim, un jeune homme de son équipe, y trouve la mort. Elle est bouleversée et a beaucoup de mal à le cacher, d’autant que Will est chargé de l’enquête. Il est d’ailleurs très efficace et remonte une piste jusqu’au stand de tir secret, où se trouve la moitié de leur armement. C’est un coup dur pour la résistance. Quayle craint que Will ne réussisse aussi à remonter jusqu’à leur cellule et demande à Katie, par le biais de Broussard, de se servir au maximum de son mari pour obtenir des informations. Le cas échéant, il éliminera Will, qu’il juge trop dangereux pour eux. Furieuse, Katie accepte, mais elle fait promettre Broussard de ne jamais s’en prendre à son époux. En échange, elle soutirera autant d’informations que possible à celui-ci. Pia, la petite amie de Bram, lui confie un secret : son cousin, Pedro, et elle ont découvert un tunnel sous le mur, d’où ils arrivent à récupérer des vivres venant "de l’autre côté". Parallèlement à tous ces évènements, la réouverture du Yonk est un succès. Will cherche toujours d’où vient la fuite dans son service. Loin d’imaginer qu’il s’agit de sa propre femme, il suspecte Jennifer, sa collègue zélée.

Katie envoie ses enfants au parc avec Lindsey le temps que Broussard jette un cocktail Molotov dans son salon. Cette ruse devrait permettre à Katie d'identifier Phyllis lors de son interrogatoire, afin que la résistance s'en débarrasse. Lors de la fouille de la maison des Bowman, les casques rouges trouvent des enregistrements des émissions de Geronimo dans la chambre de Bram. Phyllis prévient Will et ne transmet pas les cassettes. En interrogeant son fils, Will apprend comment les émissions sont annoncées, ce qui permet à la sécurité d'arrêter Geronimo. Snyder, ravi de ce succès, s'empresse de se vanter auprès sa hiérarchie...

Les casques rouges arrêtent un jeune homme, Shawn, en possession d'affiches pro-Geronimo. Ils l'emmènent au département de la Sécurité intérieure. Will et Beau sont appelés chez Phyllis, dans la zone verte, où son mari et elle ont été retrouvés assassinés. Une inscription géante trône sur le mur de leur salon : Geronimo. Snyder est à la fois fou de rage et mort d’inquiétude. Pia entraîne Bram de l'autre côté du mur. Les deux adolescents ont accès à toutes les denrées possibles et imaginables dans cette partie de la ville, totalement déserte...

Helena discute au téléphone avec une personne haut placée et visiblement, Snyder n'est en réalité qu'un pantin placé à son poste pour de mystérieux desseins. La cellule de Quayle entre en action en tentant d'enlever Snyder, mais Will réussit à le sauver de l'embuscade tendue par Broussard et son équipe.